Kur shqyrtojmë shkaqet e infertilitetit sipas gjinisë, duket se 40-50% e rasteve të infertilitetit janë të lidhura me faktorët e infertilitetit mashkullor. Mund të ketë shumë shkaqe për infertilitetin mashkullor. Çrregullimet gjenetike, anomalitë kongjenitale, shkaqet hormonale, faktorët kimikë, sëmundjet e lidhura me inflamacionin, varikocela dhe operacionet kirurgjike janë shkaqet kryesore të infertilitetit mashkullor.
Zakonet dhe mënyrat e të ushqyerit gjithashtu luajnë një rol të rëndësishëm në zhvillimin e infertilitetit mashkullor. Pirja e duhanit dhe alkooli, steroidet, kushtet specifike të punës (mjedise shumë të nxehta ose mjedise në të cilat mund të thithen substanca kimike), si dhe pesha e tepërt mund të çojnë në infertilitet. Shkaqet e infertilitetit mashkullor mund të renditen si më poshtë:
